Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms