Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trabd2bB1ATG9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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