Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plcb2A3KGF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plcb2A3KGF7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plcb2A3KGF7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms