Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CatsperbA2RTF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CatsperbA2RTF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms