Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FocadA2AKG8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FocadA2AKG8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms