Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VirmaA2AIV2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VirmaA2AIV2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VirmaA2AIV2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms