Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc163A2AGD7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms