Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Frmpd4A2AFR3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Frmpd4A2AFR3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Frmpd4A2AFR3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms