Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chd5A2A8L1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chd5A2A8L1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chd5A2A8L1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms