Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap1-3A2A588 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap1-3A2A588 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms