Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQS1

Slc25a23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a23Q6GQS1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc25a23Q6GQS1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc25a23Q6GQS1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc25a23Q6GQS1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc25a23Q6GQS1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc25a23Q6GQS1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc25a23Q6GQS1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc25a23Q6GQS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc25a23Q6GQS1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc25a23Q6GQS1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc25a23Q6GQS1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc25a23Q6GQS1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc25a23Q6GQS1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms