Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LSSP48449 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LSSP48449 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSSP48449 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LSSP48449 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LSSP48449 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LSSP48449 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LSSP48449 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSSP48449 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSSP48449 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSSP48449 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSSP48449 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LSSP48449 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LSSP48449 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSSP48449 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LSSP48449 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LSSP48449 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSSP48449 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LSSP48449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSSP48449 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSSP48449 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSSP48449 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LSSP48449 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSSP48449 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LSSP48449 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LSSP48449 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LSSP48449 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSSP48449 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LSSP48449 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSSP48449 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LSSP48449 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSSP48449 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSSP48449 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LSSP48449 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSSP48449 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSSP48449 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSSP48449 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSSP48449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LSSP48449 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSSP48449 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSSP48449 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSSP48449 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LSSP48449 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LSSP48449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LSSP48449 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSSP48449 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSSP48449 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LSSP48449 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSSP48449 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LSSP48449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSSP48449 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LSSP48449 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSSP48449 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LSSP48449 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSSP48449 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSSP48449 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSSP48449 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LSSP48449 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSSP48449 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LSSP48449 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LSSP48449 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSSP48449 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSSP48449 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LSSP48449 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LSSP48449 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSSP48449 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LSSP48449 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LSSP48449 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LSSP48449 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LSSP48449 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LSSP48449 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LSSP48449 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LSSP48449 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSSP48449 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LSSP48449 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSSP48449 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LSSP48449 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LSSP48449 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSSP48449 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSSP48449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LSSP48449 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LSSP48449 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSSP48449 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LSSP48449 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSSP48449 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LSSP48449 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSSP48449 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSSP48449 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LSSP48449 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSSP48449 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSSP48449 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSSP48449 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LSSP48449 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LSSP48449 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms