Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrit3W8DXL4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrit3W8DXL4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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