Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd3Q9Z2D8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mbd3Q9Z2D8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms