Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tulp1Q9Z273 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tulp1Q9Z273 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tulp1Q9Z273 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms