Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccne2Q9Z238 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccne2Q9Z238 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccne2Q9Z238 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms