Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms