Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl8Q9Z121 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms