Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp2Q9Z0Z3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp2Q9Z0Z3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms