Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHTOPQ9Y3Y2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CHTOPQ9Y3Y2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms