Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ArcQ9WV31 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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ArcQ9WV31 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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ArcQ9WV31 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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ArcQ9WV31 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ArcQ9WV31 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms