Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnfsf13bQ9WU72 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms