Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggps1Q9WTN0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggps1Q9WTN0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms