Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP4Q9UKK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms