Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hic1Q9R1Y5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hic1Q9R1Y5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hic1Q9R1Y5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms