Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Wdr54Q9R0D8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms