Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
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Col4a3Q9QZS0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Col4a3Q9QZS0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Col4a3Q9QZS0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Col4a3Q9QZS0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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