Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pex3Q9QXY9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pex3Q9QXY9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms