Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpc5Q9QX29 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpc5Q9QX29 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpc5Q9QX29 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms