Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCAF13Q9NV06 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DCAF13Q9NV06 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms