Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Csnk1eQ9JMK2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csnk1eQ9JMK2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms