Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Pias4Q9JM05 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pias4Q9JM05 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms