Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd2apQ9JLQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd2apQ9JLQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd2apQ9JLQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd2apQ9JLQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms