Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc5a3Q9JKZ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Slc5a3Q9JKZ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Slc5a3Q9JKZ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms