Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ldb3Q9JKS4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ldb3Q9JKS4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms