Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp5Q9JKD3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scamp5Q9JKD3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp5Q9JKD3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms