Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gpa33Q9JKA5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms