Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pard6bQ9JK83 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pard6bQ9JK83 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms