Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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