Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpf2Q9JJ80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpf2Q9JJ80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms