Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RabggtaQ9JHK4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RabggtaQ9JHK4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RabggtaQ9JHK4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms