Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3bQ9ES34 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3bQ9ES34 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms