Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc28a3Q9ERH8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc28a3Q9ERH8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms