Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tfcp2Q9ERA0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tfcp2Q9ERA0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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