Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms