Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxcr6Q9EQ16 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr6Q9EQ16 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms