Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc97Q9DBT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms