Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ftsj3Q9DBE9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms