Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Wdr53Q9DB94 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Wdr53Q9DB94 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms