Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smg9Q9DB90 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Smg9Q9DB90 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Smg9Q9DB90 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Smg9Q9DB90 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Smg9Q9DB90 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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